Mellemskarven er beskyttet efter EU’s fuglebeskyttelsesdirektiv og bliver officielt betragtet som naturligt hjemmehørende i Danmark. Men en historisk-biologisk hypotese rejser spørgsmålet, om fuglen oprindeligt blev bragt fra Østasien til Europa med mennesker. Hvis det kan dokumenteres genetisk, kan det udfordre grundlaget for den nuværende skarvforvaltning – men forskningen giver endnu ikke et entydigt svar.